装着啤酒或其它苹果酒的瓶子很快地浸入热水中。这种巴氏杀菌器的优点是，在巴氏杀菌过程中，瓶子可以从外部得到很好的清洁。

灌装和封闭的瓶子被放入腔内，温度水平和持续时间可以通过数字控制面板编程，加热时间和冷却时间都可以调节。

啤酒通过带有几个热交换器的巴氏杀菌系统。啤酒在装瓶前要在管道中连续进行巴氏杀菌。